载入时间长
载入时间长是Flash网站存在的一个通病。可以说这是用户为了高用户体验和酷炫效果所付出的最大的代价。Flash网站会带有一定的用户交互系统、视频播放系统、音乐播放系统这都会给Flash网站载入增加不少的时间。所幸的是Flash网站开发人员的创意是无限的，他们能够在网站载入的Loading中创造一些新意的东西在里面减少我们对长时间载入的无聊等待。
Flash网站载入时间长与宽带带宽也有关系。因为Flash网站数据大，宽带带宽低两者相加就导致了Flash网站载入时间较长。这不仅仅是Flash网站遇到的问题，其他任何网站或者游戏都会受到宽带因素的影响。所幸的是，现在各大宽带供应商都在进行提高带宽降低价格的政策。相信不久之后，我们也能进入高速宽带时代，到时影响Flash网站载入时间最大的障碍宽带因素将不是难题。
优化困难
不得不说这是Flash网站对于企业来说最大的缺点。导致这种情况的主要原因是Flsah网站多以视频、音频、动画元素为主很少有文字表达，而搜索引擎对于这些元素识别困难。这是搜索引擎的问题也是Flash全站的问题。搜索引擎正在逐渐强化多Flash动漫动画图片等的识别和抓取技术。虽然Flash全站不易优化，但是SEOer的创造力也是不容我们怀疑的，网上就有很多关于Flash全站推广的方法。所以我们只能说Flash全站在不易优化，而不是不能优化。就像Flash全站制作一样，我们不是不能做Flash全站，只是Flash全站开发需要我们投入更多的精力。